FrontEnd de la plataforma de alto rendimiento para el análisis filogenético: PhylUCI

Abstract

El análisis filogenético es uno de los métodos bioinformático más utilizados para el estudio de entidades virales. En la Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI) se desarrolla la plataforma para análisis filogenético PhylUCI, la cual brinda un marco favorable a los estudios filogenéticos realizados en el país. Actualmente la plataforma cuenta con un solo módulo el BackEnd, este módulo no dispone de una interfaz que amenice el proceso a los investigadores, pues todas las herramientas se ejecutan a través de comandos. Este trabajo tiene como objetivo desarrollar una interfaz web para la plataforma, además de un visualizador y editor de árboles. Se analizó, diseñó e implementó un FrontEnd, módulo que resuelve los problemas de selección, configuración y visualización de los resultados arrojados por las herramientas que ofrece la plataforma, así como un editor de árboles filogenéticos. Estos módulos se comunicarán a través de los servicios RESTFUL. Para guiar la investigación se escogió Open Up como metodología de desarrollo, así como el patrón arquitectónico Modelo Vista Plantilla. Se trazó una estrategia de pruebas, las cuales arrojaron 24 no conformidades en 3 iteraciones, quedando todas resueltas en la última iteración, obteniendo un FrontEnd de calidad.

The phylogenetic analysis is one of the study of viral entities. The Computer Science University (UCI) a platform for the phylogenetic analysis is being developed PhylUCI, which provides a favorable framework to the phylogenetic studies carried out in our country. Nowadays this platform has only one module, the BackEnd, but this module does nat have an interface that make the process enjoyable or more interesting to the researchers, because all the tools are played through commands. The objective of this work is to develop a web interface for the platform, and also a visual display unit and an editor trees diagram. To this purpose it was analyzed designed and implemented a FrontEnd, module that salves the selection of problems, configuration and visualization of the yielded results by the tools provided by the platform, as well as a phylogenetic tree editor. These modules get connected through RESTFUL service. To guide the investigation, it was chosen Open Up as methodology of development as well as Model Sight Template, architectonic standards that will lead the development of the system. The test strategy drawn yielded 24 not conformities in three iterations, but all of then iteration with a result of a FrontEnd of quality.