Sistema de Monitoreo y Control para el Módulo de Análisis de Secuencias de la Plataforma de Servicios Bioinformáticos.

Abstract

Con el decursar de los años, Cuba ha dado pasos agigantados en el desarrollo de las Tecnologías de la Información y las Comunicaciones (TIC’s), siendo pionera en este campo la Universidad de las Ciencias Informáticas. Dicha universidad posee una red de centros productivos, entre los que se destaca el Centro de Tecnologías de Gestión de Datos (DATEC). Este centro cuenta con un departamento de Bioinformática en el que se desarrollan actualmente dos proyectos, Genética Médica y Plataforma de Servicios Bioinformáticos, este último cuenta con una serie de módulos los cuales brindan varios servicios, específicamente el Módulo de análisis de secuencias intenta proveer a los especialistas las funcionalidades comúnmente utilizadas en el área de la Bioinformática. Este sistema actualmente no está siendo gestionado por los administradores, por lo que el objetivo de la presente investigación es desarrollar un sistema de monitoreo y control de eventos para dicho módulo. Para el desarrollo de la misma se realizó el estudio de los diferentes sistemas y herramientas existentes para el monitoreo y control, así como las métricas establecidas para los mismos, definiéndose las tecnologías y programas a utilizar. Para ello se aplica la metodología de desarrollo de software OpenUp, se utiliza como lenguaje de programación Java y como herramienta para la gestión de los servidores a monitorizar se emplea Java Management Extensions (JMX, por sus siglas en inglés). Finalmente se obtuvo un componente de interfaz de usuario denominado Portlet, el cual visualiza diferentes indicadores del Módulo de análisis de secuencias tales como: estado del disco duro, memoria RAM, procesos en ejecución, entre otros, a la vez que permite tomar acciones correctivas para garantizar el correcto funcionamiento de dicho módulo. Una vez terminado se incorpora a la Plataforma de Servicios Bioinformáticos de la Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI).