Servicio de Análisis Automático de Poses Derivadas del Docking utilizando AuPosSOM para la Plataforma de Servicios Bioinformáticos.

Abstract

Antiguamente el desarrollo de medicamentos tuvo como base el conocimiento tradicional y el trabajo de laboratorio para el aislamiento de sus principios activos. En la actualidad se han creado métodos automatizados de simulación del acoplamiento molecular o docking, que contribuyen al diseño de fármacos con mayor potencia medicinal y menor toxicidad. En la Universidad se brinda este servicio mediante el módulo de Acoplamiento Molecular existente en la Plataforma de Servicios Bioinformáticos, sin embargo, no existe una herramienta capaz de interpretar los resultados arrojados por estos métodos de simulación en dicha plataforma. El presente estudio propone un Servicio de Análisis Automático de Poses Derivadas del Docking utilizando el programa AuPosSOM para insertar en el módulo de Acoplamiento Molecular de la Plataforma de Servicios Bioinformáticos de la UCI. Para ello se siguieron como principales pasos: la identificación de las herramientas de software más usadas para el desarrollo del nuevo servicio, el análisis y el diseño para insertar el AuPosSOM al módulo de Acoplamiento Molecular, y la implementación y evaluación del servicio de Análisis Automático de Poses Derivadas del Docking para la Plataforma de Servicios Bioinformáticos. El trabajo logró un servicio web de Análisis Automático de Poses Derivadas del Docking que contiene además una base de datos relacional para el almacenamiento de un gran volumen de datos. El servicio brindará al usuario la posibilidad de agrupar, a partir de los resultados del docking, las poses de salida de los compuestos en cluster por semejanza estructural, lo que facilita el análisis de los resultados y simplifica el trabajo al investigador.