Codificación tridimensional basada en álgebra lineal y multi-lineal de la estructura química de moléculas orgánicas

Abstract

En la presente investigación se proponen nuevos descriptores moleculares geométricos independientes de alineamiento basados en las formas algebraicas 2-lineales, 3-lineales y 4-lineales como casos específicos de las formas algebraicas N-lineales. Para este fin se definen las kth matrices espaciales 2-tuplas, 3-tuplas y 4-tuplas de similitud-disimilitud para representar la información química en las relaciones entre dos, tres y cuatro átomos de una molécula respectivamente. Además se proponen varias transformaciones para normalizar las representaciones matriciales definidas y se introducen estrategias para considerar relaciones inter-atómicas de interés. Por último se define un procedimiento que calcula los descriptores a partir de su descomposición a nivel atómico utilizando varios operadores matemáticos. Para calcular estos descriptores se desarrolló el software QuBiLS-MIDAS el cual aprovecha las arquitecturas multi-núcleos actuales y utiliza un sistema de cómputo distribuido para disminuir el tiempo de procesamiento.