Componente para Análisis Estadísticos de Coeficientes de Endogamia para la Solución Informática SEEGEN-R.

Abstract

En el Centro Nacional de Genética Médica (CNGM), se realizan los cálculos estadísticos de los estudios de Epidemiología Genética utilizando el Sistema Estadístico de Epidemiología Genética – basado en R (SEEGEN-R), herramienta desarrollada en la Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI) que contiene módulos para la realización de estudios de Genética Poblacional, Epidemiología Tradicional y Epidemiología Genética. Actualmente, en el CNGM, se realizan análisis estadísticos de los coeficientes de endogamia de la población, pero SEEGEN-R no contiene las funciones necesarias para la realización de los mismos. El objetivo de la presente investigación es desarrollar un componente que permita la integración de los estudios de coeficientes de endogamia para su uso por los especialistas del CNGM. Se utiliza Java como lenguaje de programación para manejar la presentación de los análisis a los usuarios y R como motor de cálculo de las funciones estadísticas. En este componente se utilizó RUP como metodología de desarrollo, Netbeans como entorno de desarrollo integrado y la librería de clases RServe para comunicar los lenguajes de programación utilizados. Como resultado se obtuvo un componente, que satisface las necesidades del CNGM, para realizar los estudios de coeficientes de endogamia en la solución informática SEEGEN-R.

Abstract The National Centre for Medical Genetic (CNGM), perform statistical calculations of the studies of genetic epidemiology using the Statistical System of Genetic Epidemiology – R based (SEEGEN-R), tool developed at the University of Informatics Sciences (UCI) that contains modules for studies of population genetics, traditional epidemiology and genetic epidemiology. Currently, in the CNGM, statistical analysis of the inbreeding coefficients in the population are made, but SEEGEN-R does not contain the functions required for the realization of the same. The objective of this research is to develop a component that allows the integration of studies of inbreeding coefficients for use by the CNGM specialists. Is used Java as a programming language to manage the presentation of the analyses to the users and R as an engine for calculation of statistical functions. RUP as methodology development, Netbeans as IDE and RServe library was used in this component to communicate the used programming languages. Was obtained as result a component, which meets the needs of the CNGM to make studies of inbreeding coefficients in the software SEEGEN-R.